Ini adalah aplikasi Linux bernama Visualization of Protein-Ligand Graphs untuk dijalankan di Linux online yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai vplg_2016_07_18.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan online aplikasi ini bernama Visualization of Protein-Ligand Graphs untuk dijalankan di Linux online dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Tangkapan layar
Ad
Visualisasi Grafik Protein-Ligand untuk dijalankan di Linux online
DESKRIPSI
Paket perangkat lunak Visualization of Protein-Ligand Graphs (VPLG) menghitung dan memvisualisasikan grafik protein. Ia bekerja pada tingkat struktur super-sekunder dan menggunakan koordinat atom dari file PDB dan penugasan SSE dari algoritma DSSP.VPLG adalah perangkat lunak baris perintah. Jika Anda tidak suka mengetik perintah, coba server web PTGL kami: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Fitur
- Membaca data atom 3 dimensi dari file PDB dan tugas struktur sekunder dari file DSSP
- Menghitung grafik protein-ligan dari data dan memvisualisasikan grafik
- Mendukung output gambar grafik dalam format bitmap (.png) dan vektor (.svg)
- Mengekspor grafik protein-ligan dalam file teks biasa dalam formatnya sendiri (.plg) yang mudah diedit, diurai, dan dibuat dengan program komputer serta dalam sejumlah format file grafik standar
- Dapat membaca dan langsung memvisualisasikan grafik protein dari .plg-files
- Perangkat Lunak Sumber Terbuka Gratis (FOSS)
- Dukungan basis data (sepenuhnya opsional, tidak ada server basis data yang diperlukan secara default)
- Antarmuka baris perintah memungkinkan pemrosesan batch yang mudah melalui skrip shell
- Memungkinkan penyaringan ligan dengan nomor atom
- GUI baru ditulis dalam Java, tidak perlu mengetik perintah konsol lagi!
- Perangkat lunak yang menggerakkan server web PTGL: http://ptgl.uni-frankfurt.de/
Para penonton
Sains/Penelitian, Pendidikan, Pengguna Akhir Tingkat Lanjut
User interface
Java Swing, Konsol/Terminal, Baris Perintah
Bahasa Pemrograman
Jawa
Lingkungan Basis Data
JDBC
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/vplg/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.
