Ini adalah aplikasi Windows bernama NGSEP yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai NGSEPwindows_4.1.0.zip. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama NGSEP dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Mulai emulator online OS OnWorks apa pun dari situs web ini, tetapi emulator online Windows yang lebih baik.
- 5. Dari OS Windows OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Unduh aplikasi dan instal.
- 7. Unduh Wine dari repositori perangkat lunak distribusi Linux Anda. Setelah terinstal, Anda kemudian dapat mengklik dua kali aplikasi untuk menjalankannya dengan Wine. Anda juga dapat mencoba PlayOnLinux, antarmuka mewah di atas Wine yang akan membantu Anda menginstal program dan game Windows populer.
Wine adalah cara untuk menjalankan perangkat lunak Windows di Linux, tetapi tidak memerlukan Windows. Wine adalah lapisan kompatibilitas Windows sumber terbuka yang dapat menjalankan program Windows secara langsung di desktop Linux apa pun. Pada dasarnya, Wine mencoba untuk mengimplementasikan kembali Windows dari awal sehingga dapat menjalankan semua aplikasi Windows tersebut tanpa benar-benar membutuhkan Windows.
SCREENSHOT:
NGSEP
DESKRIPSI:
NGSEP adalah kerangka kerja terintegrasi untuk analisis data sekuensing throughput tinggi DNA. Penggunaan utama NGSEP adalah konstruksi dan analisis hilir dari kumpulan data besar variasi genom. NGSEP melakukan deteksi akurat dan genotipe Varian Nukleotida Tunggal (SNV), indel kecil dan besar, pengulangan tandem pendek (STR), inversi, dan Varian Nomor Salin (CNV). NGSEP juga menyediakan modul untuk anotasi fungsional, pemfilteran, konversi format, perbandingan, pengelompokan, imputasi, analisis introgresi, dan berbagai jenis statistik. Daftar lengkap fungsi tersedia di wiki kami (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
BERITA: Kami baru saja menyediakan versi pertama dari assembler genom de-novo kami. Rincian lebih lanjut tersedia di wiki.
Fitur
- Perakitan genom de-novo
- Penyelarasan bacaan mentah ke genom referensi
- Deteksi SNP, CNV, dan Varian Struktural
- Manipulasi VCF: anotasi fungsional, gabungkan, filter, bandingkan, konversi format, imputasi
- Membaca Demultiplexing
- Penyelarasan rakitan genom beranotasi
- Statistik dan pemfilteran pada annptasi transkriptom dalam format GFF3
Para penonton
Industri Kesehatan, Sains/Penelitian, Audiens Lainnya, Pertanian
User interface
Java SWT, Konsol/Terminal, Eclipse
Bahasa Pemrograman
Jawa
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/ngsep/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.