asn2fsa - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

asn2fsa: converte i dati della sequenza biologica da ASN.1 a FASTA

SINOSSI

asn2fsa [-] [-A acc] [-D] [-E] [-H] [-L Nome del file] [-T] [-a Digitare] [-b] [-c] [-d sentiero]
[-e N] [-f sentiero] [-g] [-h Nome del file] [-i Nome del file] [-k] [-l] [-m] [-o Nome del file] [-p sentiero]
[-q Nome del file] [-r] [-s] [-u] [-v Nome del file] [-x str] [-z]

DESCRIZIONE

asn2fsa converte i dati della sequenza biologica da ASN.1 a FASTA.

VERSIONI

Di seguito è riportato un riepilogo delle opzioni.

- Stampa messaggio di utilizzo

-A acc Accesso al recupero

-D Usa Dash per Gap

-E Seq-id estesi

-H L'HTML si estende

-L Nome del file
File di registro

-T Usa discussioni

-a Digitare
Tipo di ingresso ASN.1:
a Automatico (predefinito)
z Qualsiasi
e Inserimento sequenziale
b Bioseq
s Set Bioseq
m Seq-invia
t elaborazione batch (adatta per rilasci ufficiali; rileva automaticamente il tipo specifico)

-b Bioseq-set è binario

-c Bioseq-set è compresso

-d sentiero
Percorso del database ReadDB

-e N Lunghezza della riga (70 per impostazione predefinita; può variare da 10 a 120)

-f sentiero
Percorso dei dati FASTA indicizzati

-g Espandi i delta gap in Ns

-h Nome del file
Nome del file di output della cache del componente remoto

-i Nome del file
File di input singolo (input standard per impostazione predefinita)

-k Recupero locale

-l Bloccare i componenti in anticipo

-m Stile principale per sequenze quasi segmentate

-o Nome del file
Nome del file di output del nucleotide

-p sentiero
Percorso ai file ASN.1

-q Nome del file
Nome del file di output del punteggio di qualità

-r Recupero remoto da NCBI

-s Contig genomico lontano per i punteggi di qualità

-u Recurse

-v Nome del file
Nome del file di output delle proteine

-x str Sottostringa di selezione file (.ent per impostazione predefinita) [Stringa]

-z Divario nel punteggio di qualità di stampa pari a -1

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