cmtk-asegment_sri24 - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

asegment_sri24 - Segmentazione utilizzando l'atlante SRI24

SINOSSI

aegment_sri24 Immagine di destinazione Immagine di output

DESCRIZIONE

Registra un'immagine target su un canale selezionato dell'atlante del cervello umano SRI24, quindi
riformattare una delle mappe dell'etichetta dell'atlante sull'immagine di destinazione. Nota: si assume che il
l'immagine target è spogliata del cranio, cioè contiene solo il cervello.

VERSIONI

globali Kit di strumenti Opzioni (questi sono condiviso by contro tutti i CMTK utensili)
--Aiuto
Scrivere l'elenco delle opzioni di base della riga di comando nell'output standard.

--aiuto-tutti
Scrivere l'elenco completo delle opzioni della riga di comando di base e avanzate nell'output standard.

--wiki
Scrivi l'elenco delle opzioni della riga di comando nell'output standard nel markup di MediaWiki.

--uomo
Scrivi il sorgente della pagina man nel markup 'nroff' sullo standard output.

--xml
Scrivere la specifica della sintassi della riga di comando nel markup XML (per l'integrazione di Slicer).

--versione
Scrivi la versione del toolkit nell'output standard.

--eco
Scrive la riga di comando corrente nell'output standard.

--livello-verboso
Imposta il livello di verbosità.

--verboso, -v
Incrementa il livello di verbosità di 1 (deprecato; supportato per compatibilità con le versioni precedenti).

--thread
Imposta il numero massimo di thread paralleli (per thread POSIX e OpenMP).

Principale Opzioni
--veloce, -f
Modalità veloce.

--registrazione-canale
Il canale SRI24 utilizzato per la registrazione all'immagine di destinazione. Valori supportati:
"spgr", "early-fse", "late-fse", "fa", dove il valore predefinito è "spgr", oppure utilizzare uno dei
seguenti:

--spgr
Canale strutturale SPGR (ponderato in T1) [Questo is , il predefinito]

--early-fse
Canale dell'eco con rotazione rapida dell'eco precoce (ponderato PD)

--late-fse
Late-echo (ponderato T2) canale di eco a rotazione rapida

--fa Canale di anisotropia frazionale, derivato da immagini del tensore di diffusione

--label-mappa
La mappa dell'etichetta SRI24 che viene riformattata nell'immagine di destinazione. Valori supportati:
"tzo116plus", "lpba40", "tissue", dove il valore predefinito è "tzo116plus", oppure utilizzare uno dei
il seguente:

--tzo116plus
Modello di parcellizzazione corticale estesa basato sulla regione di Tzourio-Mazoyer AAL 116
modello. [Questo is , il predefinito]

--lpba40
Modello basato sulla segmentazione LONI Probabilistic Brain Atlas di 40 soggetti.

--fazzoletto di carta
SRI24 segmentazione tissutale a tre compartimenti di massima verosimiglianza (GM, WM, CSF)
Mappa.

AUTORI

Torsten Rohlfing, con contributi di Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff e Yaroslav Halchenko

Usa cmtk-asegment_sri24 online utilizzando i servizi onworks.net