Questo è il comando exonpairs che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
exonpairs - esonpairs del modulo SNAP
SINOSSI
esonpari [Opzioni]HMM filetto>VELOCE filetto> [Opzioni]
VERSIONI
-min-introne
lunghezza minima dell'introne [30]
-max-introne
lunghezza massima dell'introne [10000]
-einit-lunghezza
lunghezza minima Einit in bp [10]
-eterm-lunghezza
lunghezza minima Eterm in bp [10]
-lunghezza dell'esone
Lunghezza minima dell'esone in bp [30]
-punteggio intron punteggio minimo dell'introne in bit [-5]
-einit-punteggio
punteggio Einit minimo in bit [-5]
-eterm-punteggio
punteggio Eterm minimo in bit [-5]
-punteggio-esone
Punteggio minimo dell'esone in bit [-5]
-punteggio della coppia
punteggio minimo della coppia (esone-introne-esone) [10]
-lunghezza del fianco
lunghezza della sequenza fiancheggiante per esone [20]
-lmaschera
tratta la minuscola come N
Utilizza exonpairs online utilizzando i servizi onworks.net
