Questo è il comando extractseqe che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
extractseq - Estrai regioni da una sequenza
SINOSSI
estrarreseq -sequenza sequenza -regioni gamma [-separato booleano] -successivo seguito
estrarreseq -Aiuto
DESCRIZIONE
estrarreseq è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Modifica".
VERSIONI
Ingresso pagina
-sequenza sequenza
Obbligatorio pagina
-regioni gamma
Regioni da estrarre. Un insieme di regioni è specificato da un insieme di coppie di posizioni. Il
le posizioni sono numeri interi. Sono separati da qualsiasi carattere non numerico e non alfabetico.
Esempi di specifiche regionali sono: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 Valore predefinito: $(sequence.begin)-$(sequence.end)
aggiuntivo pagina
-separato booleano
Se questo è impostato su true, ogni regione specificata viene scritta come una sequenza separata.
Il nome della sequenza viene creato dal nome della sequenza originale con il
posizioni di inizio e fine dell'intervallo aggiunti con caratteri di sottolineatura tra di loro,
ad esempio: la regione XYZ da 2 a 34 è scritta come: XYZ_2_34 Valore predefinito: N
Uscita pagina
-successivo seguito
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