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gt-tallymer-search - Online nel cloud

Esegui gt-tallymer-search nel provider di hosting gratuito OnWorks su Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS

Questo è il comando gt-tallymer-search che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS

PROGRAMMA:

NOME


gt-tallymer-search - Cerca un insieme di k-mer in un indice costruito da ``gt tallymer
mkindex''.

SINOSSI


gt talmero Ricerca [opzioni] -tyr tallymer-index -q queryfile0 [queryfile1..] [opzioni]

DESCRIZIONE


-tir [stringa]
specificare indice tallymer (predefinito: non definito)

-q
specificare i nomi dei file di query

-filo [stringa]
specificare il filo da ricercare: utilizzare f (per filo in avanti) o p (per filo inverso
filamento complementato) o fp (per entrambi); il valore predefinito è f (predefinito: f)

-produzione
specificare i flag di output (qseqnum, qpos, counts, sequence)

-v [si|no]
essere prolisso (predefinito: no)

-Aiuto
visualizza la guida ed esci

-versione
visualizza le informazioni sulla versione ed esci

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