Questo è il comando newicktotxt che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
njplot - Un programma di disegno di alberi filogenetici per biologi newicktops - draw phylogenetic
alberi in un file PostScript
SINOSSI
njplot [Opzioni] file_albero
capotte [Opzioni] file_albero
newicktotxt [Opzioni] file_albero
DESCRIZIONE
Questa pagina di manuale documenta brevemente il njplot comando.
Le capotte comando fa esattamente lo stesso ma non necessita di display X11. L'uscita è
reso in un file PostScript.
Le newicktotxt comando fa esattamente lo stesso di capotte ma l'output viene visualizzato
in un file di testo.
Questa pagina di manuale è stata riscritta per la distribuzione Debian GNU/Linux perché l'originale
il programma non ha una pagina di manuale.
njplot è un programma di disegno di alberi in grado di disegnare qualsiasi albero binario o multi-ramificato espresso
nel formato standard dell'albero filogenetico (ad es. il formato utilizzato dal pacchetto PHYLIP).
NJplot è particolarmente conveniente per radicare gli alberi senza radici ottenuti dalla parsimonia,
metodi di costruzione di alberi a distanza o massima verosimiglianza.
Qualsiasi radice dell'albero senza radice può essere specificata in modo interattivo utilizzando il mouse. NJplot
consente anche lo zoom, lo scambio di rami, la visualizzazione dei punteggi bootstrap e il salvataggio nel
Formato PostScript. NJplot può quindi essere utilizzato come estensione grafica di qualsiasi pacchetto
di un programma filogenetico che impiega il formato albero standard per la memorizzazione degli alberi (ad es.
con la maggior parte di tali pacchetti).
VERSIONI
Ci sono solo le seguenti opzioni che funzionano solo in un x-terminal-emulator, ma non in
modalità console:
-h Stampa una breve guida.
-noi File dell'albero Postscript preparato per il formato carta US Letter.
-pssolo
Nessuna interfaccia a finestra, basta scrivere il file dell'albero PostScript.
-dimensione n
Dimensione del carattere n utilizzata per i nomi dei taxon.
-pc n numero di pagine per l'output PostScript.
-dimensione larghezzaxaltezza
dimensione della pagina PostScript espressa come WIDTHxHEIGHT.
-lunghezze
Mostra le lunghezze dei rami se compaiono nel file dell'albero.
-stivale Mostra i valori bootstrap se appaiono nel file ad albero.
-senza titolo
Non includere il titolo nell'output PostScript.
Usa newicktotxt online utilizzando i servizi onworks.net
