Questo è il comando stretchere che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici postazioni di lavoro online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
barella - Allineamento globale rapido di Needleman-Wunsch di due sequenze
SINOSSI
barella -una sequenza sequenza -bsequenza sequenza [-file di dati matrice] [-aperta numero intero]
[-estendere numero intero] -file di uscita allineare
barella -Aiuto
DESCRIZIONE
barella è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Allineamento: Globale".
VERSIONI
Ingresso pagina
-una sequenza sequenza
-bsequenza sequenza
-file di dati matrice
Questo è il file della matrice di punteggio utilizzato quando si confrontano le sequenze. Per impostazione predefinita è il
il file 'EBLOSUM62' (per le proteine) o il file 'EDNAFULL' (per le sequenze nucleiche). Queste
i file si trovano nella directory 'data' dell'installazione di EMBOSS.
aggiuntivo pagina
-aperta numero intero
Valore predefinito: @($(acdprotein)? 12 : 16)
-estendere numero intero
Valore predefinito: @($(acdprotein)? 2 : 4)
Uscita pagina
-file di uscita allineare
Usa barella online utilizzando i servizi onworks.net
