Questo è il comando substitch.pl che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
substitch.pl -- Dividi/unisci file di punti in/da file di punti
SINOSSI
substitch.pl --split 5 allchromosomes.stitch #dividi il punto grande in 5 più o meno uguali
pezzi
substitch.pl --project allspecies.seqs sub.anchors #proietta alcuni ancoraggi in un altro
spazio delle coordinate (purché le sequenze dei componenti del punto corrispondano)
VERSIONI
--verbose => rende più dettagliato --faketfidf => falsi punteggi tfidf basati sulle statistiche del punteggio in
filetto
Nota sulla suddivisione: questo programma non pretende di produrre una suddivisione ottimale. Ci prova a
coppia euristica, perfeziona i risultati e sceglie la migliore disposizione trovata finora.
Tecnicamente questa è una variazione del tradizionale "problema dell'imballaggio del bagagliaio", che è (at
almeno nel caso astratto) NP-difficile, se ricordo bene 15-251. Questo particolare
tuttavia, la varietà di imballaggio del bagagliaio sembra che dovrebbe essere risolvibile più velocemente (nel peggiore dei casi, alcuni
n ^ k programmazione dinamica, penso, ma scommetto che in questo modo è più veloce e molto più facile
scrivere per il 90% dei casi). Se qualcuno che legge questo dice "Imbecille, questo sì
stato risolto già mille volte", per favore fatemi sapere come: [email protected]
Utilizza substitch.pl online utilizzando i servizi onworks.net
