Questo è il comando trna2sap che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
trna2sap: converte l'output di tRNAscan-SE in un oggetto ASN.1 Seq-annot
SINOSSI
trna2sap [-] [-a] [-c str] [-f str] [-i Nome del file] [-j] [-m str] [-n str] [-o Nome del file]
[-p dir] [-r dir] [-s] [-t str] [-u] [-x str]
DESCRIZIONE
trna2sap legge un file di testo prodotto da tRNAscan-SE e produce un corrispondente ASN.1 Seq-
annotare nel formato riconosciuto da altri strumenti NCBI.
VERSIONI
Di seguito è riportato un riepilogo delle opzioni.
- Stampa messaggio di utilizzo
-a Aggiungi la citazione tRNAscan-SE
-c str Commento
-f str Filtro sottostringa
-i Nome del file
File di input singolo (input standard per impostazione predefinita)
-j Basta produrre una tabella delle funzionalità a cinque colonne, à la trna2tbl(1).
-m str Osservazione
-n str Nome dell'annotazione (normalmente "tRNA").
-o Nome del file
File di output singolo (output standard per impostazione predefinita)
-p dir Percorso dei file
-r dir Percorso per i risultati
-s Ignorare gli pseudo tRNA
-t str Titolo dell'annotazione (normalmente "tRNAscan-SE").
-u Ignorare i tRNA indeterminati
-x str Suffisso di selezione file con -p (.trna per impostazione predefinita).
Utilizza trna2sap online utilizzando i servizi onworks.net
