Questo è il comando vcf-phased-join che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
vcf-phased-join: prende più blocchi pre-fasati sovrapposti e li concatena in
un VCF
SINOSSI
vcf-fase-join [VERSIONI] A.vcf B.vcf Cvcf
DESCRIZIONE
Informazioni: lo script prende più blocchi pre-fase sovrapposti e li concatena in
un VCF
utilizzando chiamate eterozigoti dalle sovrapposizioni per determinare la fase corretta.
VERSIONI
-j, --min-join-qualità
Soglia di qualità per l'incollaggio dei blocchi prefasati [10]
-l, --elenco
Elenco dei VCF a cui aderire.
-o, --produzione
Nome del file di output. Quando viene fornito "-", verranno utilizzati STDOUT e STDERR
-q, --min-PQ
Interrompere i segmenti pre-fasati se il valore PQ è inferiore nei VCF di ingresso [0.6]
-h, -?, --Aiuto
Questo messaggio di aiuto
Usa vcf-phased-join online utilizzando i servizi onworks.net
