Questo è il comando vina che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
vina - attracco di piccole molecole contro le proteine
DESCRIZIONE
Ingresso:
--recettore arg
parte rigida del recettore (PDBQT)
--flettere arg
catene laterali flessibili, se presenti (PDBQT)
--ligando arg
ligando (PDBQT)
Cerca spazio (necessario):
--center_x arg
Coordinata X del centro
--center_y arg
Coordinata Y del centro
--center_z arg
Coordinata Z del centro
--dimensione_x arg
dimensione nella dimensione X (Angstroms)
--taglia_y arg
dimensione nella dimensione Y (Angstroms)
--taglia_z arg
dimensione nella dimensione Z (Angstroms)
Uscita (facoltativo):
--fuori arg
modelli di output (PDBQT), il valore predefinito viene scelto in base al nome del file del ligando
--tronco d'albero arg
facoltativamente, scrivi il file di registro
Varie (facoltativo):
--processore arg
il numero di CPU da utilizzare (l'impostazione predefinita è provare a rilevare il numero di CPU o,
in caso contrario, utilizzare 1)
--seme arg
seme casuale esplicito
--esaustività arg (=8) esaustività della ricerca globale (approssimativamente
proporzionale al tempo): 1+
--num_mode argomento (=9)
numero massimo di modalità di associazione da generare
--range_energia argomento (=3)
massima differenza di energia tra la migliore modalità di rilegatura e la peggiore visualizzata
(kcal/mol)
Configurazione filetto (facoltativo):
--config arg
le opzioni di cui sopra possono essere messe qui
Informazioni (facoltativo):
--Aiuto visualizza il riepilogo dell'utilizzo
--help_avanzato
visualizza il riepilogo dell'utilizzo con opzioni avanzate
--versione
visualizzare la versione del programma
Usa vina online utilizzando i servizi onworks.net
