Questa è l'app Linux denominata Genomic Binding Sites Analyzer (BiSA) per l'esecuzione in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come BiSA_windows_app_0.96.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata Genomic Binding Sites Analyzer (BiSA) per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Genomic Binding Sites Analyzer (BiSA) per l'esecuzione in Linux online
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DESCRIZIONE
BiSA è una risorsa di database bioinformatica che consente agli investigatori di eseguire una serie di analisi di regioni genomiche sovrapposte utilizzando i propri set di dati o contro la Knowledge Base precaricata. I risultati dell'analisi possono essere limitati a un cromosoma; è possibile impostare la sovrapposizione minima della coppia di basi in due insiemi o la distanza massima tra le regioni; così come la distanza massima consentita tra i centri regionali. BiSA è in grado di segnalare regioni sovrapposte che condividono coppie di basi comuni; regioni vicine; regioni che non si sovrappongono; dimensioni medie della regione. BiSA può anche annotare le regioni di interesse di legame con i geni vicini. I risultati dell'analisi di sovrapposizione possono essere importati nella Knowledge Base, consentendo loro di passare all'analisi a valle e all'annotazione indipendente. Nel software è integrato anche uno strumento di diagramma di Venn per consentire agli utenti di visualizzare i risultati di sovrapposizione.Pubblico
Industria sanitaria
Interfaccia utente
Basato sul Web, Win32 (MS Windows)
Linguaggio di programmazione
Do#, Python
Ambiente database
ADO.NET, Microsoft SQL Server, altri DBMS basati su rete, basati su SQL
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/bisa/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.