Questa è l'app Linux denominata SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster la cui ultima versione può essere scaricata come swaphi-ls-v1.0.12.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
SWAPHI-LS: Allineamento su Xeon Phi Cluster
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DESCRIZIONE
Il primo algoritmo parallelo di Smith-Waterman che sfrutta i cluster Intel Xeon Phi per accelerare l'allineamento di lunghe sequenze di DNA. Questo algoritmo è scritto in C++ (con un insieme di estensioni intrinseche SIMD), OpenMP e MPI. La valutazione delle prestazioni ha rivelato che il nostro algoritmo raggiunge prestazioni molto stabili e fornisce prestazioni fino a 30.1 GCUPS su un singolo Xeon Phi e fino a 111.4 GCUPS su quattro Xeon Phi che condividono un host.Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/terminale, riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.