Questa è l'app Linux denominata ADOMA per l'esecuzione in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come adoma-1.0.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata ADOMA per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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ADOMA per funzionare in Linux online
DESCRIZIONE
ADOMA sta per: Visualizzazione alternativa di allineamento multiplo. ADOMA può creare quattro diverse visualizzazioni di un allineamento di sequenze multiple: un allineamento ClustalW in formato HTML, un allineamento ClustalW semplificato in formato HTML e/o txt e un allineamento ClustalW colorato in formato HTML. Per esempi di questi file di output, controlla gli screenshot. ADOMA utilizza ClustalW per creare l'allineamento multiplo da sequenze di DNA o proteine e le visualizza in modo leggermente diverso dal normale output di ClustalW. ADOMA è un programma a riga di comando che può essere facilmente utilizzato nelle pipeline.Per maggiori informazioni controlla il README.md nella sezione File.
Come citare ADOMA:
Zaal, D. e Nota, B. (2016), ADOMA: uno strumento da riga di comando per modificare l'output di allineamento multiplo ClustalW. Mol. Inf., 35: 42-44. doi: 10.1002/minf.201500083
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/minf.201500083/abstract
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Shell Unix, Python
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/adoma/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
