Questa è l'app Linux chiamata BADASS la cui ultima versione può essere scaricata come badass.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app chiamata BADASS con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
BADASS
DESCRIZIONE:
BADASS è un software con un'interfaccia grafica di facile utilizzo applicata alla ricerca e all'analisi della diversità delle batteriocine nei dati di sequenziamento dell'intero metagenoma. La ricerca delle sequenze di batteriocine viene eseguita con strumenti come BLAST o DIAMOND utilizzando come riferimento il database BAGEL4. Le presunte sequenze di batteriocine identificate vengono utilizzate per determinare l'abbondanza e la ricchezza delle tre classi finora descritte. L'abbondanza viene calcolata confrontando le letture identificate come batteriocine con le letture identificate come gene rRNA 16S utilizzando il database SILVA come riferimento. L'utente è in grado di modificare i parametri principali dell'analisi nell'interfaccia grafica.
Caratteristiche
- La versione badass_v1.2 offre la possibilità di eseguire MAC e Windows. Oltre a Linux.
Questa è un'applicazione che può anche essere recuperata da https://sourceforge.net/projects/badass/. È stato ospitato in OnWorks per poter essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.