Questa è l'app Linux denominata Calis-p la cui ultima versione può essere scaricata come Calisp-2.1.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata Calis-p con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI:
Calis-p
DESCRIZIONE:
Calis-p (The CALgary approach to ISotopes in proteomics) è un'applicazione Java per stimare la composizione isotopica (ad esempio delta13C o delta15N) di singole specie in una comunità microbica da un set di dati proteomici. Calis-p 2.0 gestisce sia le abbondanze di isotopi naturali che i dati di esperimenti di etichettatura come il sondaggio di isotopi stabili (SIP). Richiede un mzIdent (o corrispondenza dello spettro target) e file mzML come input e richiede circa 1 minuto per file mzML con 10 thread e richiede <10 Gb di RAM. È stato testato con i dati di varie piattaforme di cromatografia liquida nano/Orbitrap. Per SIP di successo, è estremamente sensibile, ma richiede che la frazione 13C rimanga al di sotto del 10%.
Caratteristiche
- delta13C è stimato da un set di dati metaproteomico standard
- Ottieni in modo efficiente e affidabile delta13C per molte specie in campioni di microbioma.
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/calis-p/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.