Questa è l'app Linux denominata CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 è ora disponibile] la cui ultima versione può essere scaricata come CSBB-v3.0.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 è ora disponibile] con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 è ora disponibile]
DESCRIZIONE
CSBB è una suite bioinformatica basata su riga di comando per analizzare i dati biologici acquisiti attraverso varie vie di esperimenti biologici. CSBB è implementato in Perl, mentre sfrutta anche l'uso di R, java e ruby in background per moduli specifici. L'obiettivo principale di CSBB è consentire agli utenti della comunità di biologia e bioinformatica di trarre vantaggio dall'esecuzione di attività di analisi a valle eliminando la necessità di scrivere codice di programmazione. CSBB è attualmente disponibile su piattaforme Linux, UNIX e Windows.
Attualmente CSBB fornisce 17 moduli incentrati su attività analitiche come normalizzazione, visualizzazione, statistica, RNA-SEQ ecc.
Caratteristiche
- RNA SEQ
- Espressione differenziale
- Visualizzazione interattiva
- statistica
- Interazione proteina proteina
- Normalizzazione
- Altre utilità
- Open Source
- Uso pubblico generale
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/csbb-v2-1/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.