Questa è l'app Linux denominata CUSHAW3: Accurate Short-read Alignment la cui ultima versione può essere scaricata come cushaw3-v3.0.3.tar.bz2. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata CUSHAW3: allineamento accurato a lettura breve con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
CUSHAW3: allineamento accurato a lettura breve
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DESCRIZIONE
CUSHAW3 è un allineatore open source parallelizzato, sensibile e accurato a lettura breve. Questo allineatore propone un approccio generale per allineare correttamente sia le letture facili che quelle difficili a genomi di grandi dimensioni come il genoma umano. Esegui la valutazione sui reali di qualità dell'allineamento che CUSHAW3 supera costantemente CUSHAW2, BWA-MEM, Bowtie2 e GEM in termini di allineamento single-end e paired-end. Inoltre, il nostro allineatore ha dimostrato prestazioni di allineamento paired-end migliori rispetto a Novaalign3 per letture brevi con tassi di errore elevati.
Interfaccia utente
Console/Terminale
Linguaggio di programmazione
C++
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/cushaw3/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
