Questa è l'app Linux denominata denovo_solid_pipeline la cui ultima versione può essere scaricata come denovo_solid_pipeline_1.0.1.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata denovo_solid_pipeline con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
denovo_solid_pipeline
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DESCRIZIONE
denovo_solid_pipeline (DSP) è una pipeline semi automatizzata per l'assemblaggio di genomi brevi utilizzando i dati di sequenziamento SOLiD. Le caratteristiche principali della pipeline sono l'ottimizzazione del numero di esecuzioni di correzione della lettura e delle risorse computazionali tramite la programmazione dinamica. DSP ha anche il vantaggio rispetto alla pipeline attualmente disponibile (denovo2) di generare più contigs adatti per ulteriori fasi di assemblaggio, aumentando le possibilità di rilevare errori di sequenziamento e/o siti polimorfici.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/Terminale
Linguaggio di programmazione
Shell Unix
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere recuperata da https://sourceforge.net/projects/denovosolid/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
