Questa è l'app Linux denominata mCarts la cui ultima versione può essere scaricata come mCarts.v1.2.0.tgz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata mCarts con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
mCarts
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DESCRIZIONE
Molti RBP riconoscono sequenze molto corte e degenerate, con una specificità di targeting ottenuta da meccanismi come il legame sinergico a più siti raggruppati e la modulazione dell'accessibilità del sito attraverso diverse strutture secondarie di RNA. mCarts integra il numero e la spaziatura dei singoli siti motivo, la loro accessibilità e conservazione, il che migliora sostanzialmente il rapporto segnale/rumore. Questo algoritmo apprende e quantifica le regole di queste caratteristiche, sfruttando un gran numero di siti di legame RBP in vivo ottenuti dal sequenziamento ad alto rendimento di RNA isolati mediante cross-linking e immunoprecipitazione (HITS-CLIP). Abbiamo applicato questo algoritmo per studiare due RBP rappresentativi, Nova e Mbnl. Nonostante il contenuto di informazioni molto basso nei singoli elementi del motivo, il nostro algoritmo ha fatto previsioni molto specifiche per una validazione sperimentale di successo.
Pubblico
Scienza/Ricerca, Utenti finali avanzati
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mcarts/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
