Questa è l'app Linux denominata MDcons (Molecular Dynamics consensus) la cui ultima versione può essere scaricata come mdcons-src-2.0.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MDcons (consenso di dinamica molecolare) con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
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MDcons (consenso sulla dinamica molecolare)
DESCRIZIONE
MDcons è uno strumento per analizzare i contatti conservati durante le simulazioni di dinamica molecolare (MD) di complessi a base di proteine, RNA, DNA e ligando. L'input è una traiettoria di dinamica molecolare o una serie di istantanee. L'input può anche essere una singola istantanea. Le uscite sono (1) mappa dei contatti più/meno frequentemente conservati durante MD (2) un elenco dei contatti più/meno frequentemente conservati durante MD.
Caratteristiche
- MDcons viene eseguito su oltre 2000 snapshot MD in meno di 2 minuti
- MDcons gestisce sia i complessi di proteine, RNA e DNA
- MDcons gestisce traiettorie/istantanee con o senza identificatore di catena
- MDcons è compatibile con GROMACS
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Console/terminale, riga di comando
Linguaggio di programmazione
Fortran, Pitone
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/mdcons/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
