Questa è l'app Linux denominata MIRA la cui ultima versione può essere scaricata come mira-4.0.2.tar.bz2. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MIRA con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
PACE
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DESCRIZIONE
MIRA - Sequence assembler e sequence mapping per l'intero genoma shotgun e dati di sequenziamento EST/RNASeq. Può utilizzare i dati Sanger, 454, Illumina e IonTorrent. PacBio: CCS e dati corretti da errori utilizzabili, non ancora corretti.
Caratteristiche
- Consente assemblaggi ibridi di dati Sanger, 454, Solexa, IonTorrent e PacBio (CCS & ecCLR)
- Può utilizzare dati paired-end e/o non accoppiati
- Supporta dati ausiliari in formato TRACEINFO (da NCBI)
- Contrassegna i luoghi di interesse con tag in modo che possano essere trovati rapidamente nei programmi di finitura
- Dispone di una pipeline di analisi SNP per il sequenziamento dei dati di virus e procarioti
Pubblico
Utenti finali avanzati, scienza/ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mira-assembler/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
