Questa è l'app Linux denominata MPICorMat la cui ultima versione può essere scaricata come MPICorMat_v3.0.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MPICorMat con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
MPICorMat
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DESCRIZIONE
MPICorMat è uno strumento parallelo per costruire matrici di similarità di correlazione come parte della procedura per generare reti di coespressione genica. Questo strumento prende come input una matrice con i valori di espressione (un valore float) per diversi geni osservati da diversi campioni. È una parallelizzazione del primo modulo del tool RMTGenNet (https://github.com/spficklin/RMTGeneNet). Gli utenti RMTGeneNet possono scambiare questo modulo CCM con MPICorMat, beneficiare del suo calcolo veloce per generare la somiglianza
matrice, quindi utilizzare la matrice di somiglianza come input per il secondo modulo (RMM) per
costruire la rete di co-espressione genica finale.
Pubblico
Informatica, Industria sanitaria, Scienza/Ricerca
Interfaccia utente
Console/terminale, riga di comando
Linguaggio di programmazione
C++
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mpicormat/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
