Questa è l'app Linux denominata OptimizeSNP la cui ultima versione può essere scaricata come Optimize1.0code.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata OptimizeSNP con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
Ottimizza SNP
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DESCRIZIONE
Il programma applica la programmazione lineare per ridurre al minimo il numero di microarray e gli esperimenti di ibridazione che devono essere intrapresi per coprire la maggior parte degli SNP espressi previsti. Dipendenze:. 1) mampl.exe deve essere nel PATH di sistema 2) CPLEX 12.2 deve essere installato. cplexamp.exe deve essere nel PATH di sistema
mampl.exe può essere ottenuto da qualsiasi programma contenente AMPL. Ho ottenuto AMPL dalla versione di prova di MOSEK su http://www.mosek.com/. CPLEX 12.0 può essere ottenuto da http://www-01.ibm.com/software/integration/optimization/cplex-optimizer/. È possibile ottenere una licenza accademica gratuita compilando l'applicazione per l'iniziativa accademica IBM.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Perl
Ambiente database
Archivio base
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/optimizesnp/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
