Questa è l'app Linux denominata PARSEC - PAtteRn SEarch / Context da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come PARSEC_Deployment_Package_v2.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata PARSEC - PAtteRn SEarch / Context per l'esecuzione in Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI
Ad
PARSEC - RICERCA PATTERN / Contesto per l'esecuzione in Linux online
DESCRIZIONE
La caratterizzazione dei siti genomici è una sfida importante nella comprensione e nello sfruttamento dei dati di sequenziamento di prossima generazione. La maggior parte dei siti genomici sono rappresentati da motivi brevi e degenerati con una distribuzione sparsa e talvolta con funzione biologica (es: regolazione dell'espressione genica, pattern di splicing o segnali epigenetici). Questi motivi sono associati a un'enorme quantità di rumore e quindi lo sviluppo di una piattaforma computazionale per il rilevamento accurato dei siti genomici richiede l'integrazione di vari dati biologici su larga scala per filtrare i falsi positivi.PARSEC rappresenta una soluzione intuitiva, modulare (facilmente estensibile) e all-in-one per l'integrazione efficiente di molte diverse informazioni genomiche al fine di eseguire la localizzazione e la caratterizzazione non lineare di siti biologici in un ambiente user-friendly.
Consulta il wiki per i requisiti hardware e i browser supportati.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Web based-
Linguaggio di programmazione
C++, Java
Ambiente database
JDBC, MySQL, PostgreSQL (pgsql)
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/genomicparsec/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
