Questa è l'app Linux denominata PolyCTLDesigner la cui ultima versione può essere scaricata come dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata PolyCTLDesigner con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
PolyCTL Designer
DESCRIZIONE:
Dati i peptidi (epitopi delle cellule T) PolyCTLDesigner seleziona le sequenze fiancheggianti per ottimizzare il legame TAP e unisce gli oligopeptidi risultanti in un poliepitopo in modo da fornire un'efficiente liberazione di potenziali epitopi mediante elaborazione proteasomica e/o immunoproteasomiale e riducendo al minimo il numero di epitopi giunzionali. Per la costruzione di poliepitopi, PolyCTLDesigner utilizza modelli di aminoacidi noti di scissione del proteasoma e specificità di legame TAP. PolyCTLDesigner è anche in grado di scegliere peptidi antigenici che coprono il repertorio HLA selezionato con il tasso di ridondanza desiderato. Date le sequenze antigeniche PolyCTLDesigner è anche in grado di selezionare epitopi T-helper. Per prevedere gli epitopi delle cellule T utilizza TEpredict.
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Python
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.