Questa è l'app Linux denominata SpiKeDeteKt la cui ultima versione può essere scaricata come SpikeDetekt0.1.2.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata SpiKeDeteKt con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
SpiKeDeteKt
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DESCRIZIONE
Questo è un programma di rilevamento automatico dei picchi che tiene conto della geometria della sonda e produce un file .mask da utilizzare con la nuova versione mascherata di KlustaKwik.
Ti consigliamo di utilizzare Python 2.6 o 2.7, ad esempio una versione accademica gratuita può essere ottenuta da Entthought Python.
I file di input per SpiKeDeteKt sono:
.dat (file dati grezzi)
.probe (file sonda, descritto di seguito - costruito dall'utente)
parametri.py (opzionale - altrimenti usa defaultparameters.py)
SpiKeDeteKt emette i seguenti file:
.fet.n (file di funzionalità)
.mask.n (necessario per utilizzare il nuovo (mascherato) KlustaKwik)
.clu.n (un banale file di indizi dove tutto è messo in un singolo cluster)
.fmask.n (trial - maschere float invece di binari, lo stiamo usando per testare KlustaKwik mascherato)
.spk.n (file di picco)
.upsk.n (forma d'onda di picco non filtrata)
.res.n (elenco dei tempi di picco)
.xml (un file xml con tutti i parametri che potrà essere successivamente utilizzato da neuroscope o klusters)
.fil (dati filtrati passa-alto)
.h5 (
Pubblico
Scienza / Ricerca
Linguaggio di programmazione
Python
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/spikedetekt/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online in modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.
