Questa è l'app Windows denominata 123VCF la cui ultima versione può essere scaricata come 123VCF_binary.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata 123VCF con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
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123VCF
DESCRIZIONE
123VCF è stato sviluppato per rendere più affidabile ed efficiente la fase di filtraggio dei file VCF.
Può essere utilizzato nella fase più importante del sequenziamento dell'intero esoma e dell'analisi dei dati di sequenziamento dell'intero genoma nella ricerca e anche in contesti clinici.
Ottiene solo il file dell'ordine di filtraggio e il file delle varianti, quindi filtra le varianti in base a ciò che hai ordinato tramite il file dell'ordine di filtraggio.
Manuale utente:
https://dl.adbioinformatics.net/123VCF/123VCF_Manual.ver1.pdf
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Autori: Milad Eidi, Samaneh Abdolalizadeh, Soheila Moeini
Supervisori: Javad Zahiri, PhD - Masoud Garshasbi, PhD
Caratteristiche
- Interfaccia utente grafica
- Facile da usare
- Facile da capire
- File VCF compressi o non compressi come input
- Varianti sopravvissute presenti nel formato VCF, formato separato da tabulazioni
- 123VCF inserisce le stesse varianti della funzionalità BED quando l'utente definisce un filtro BED uno accanto all'altro in un file TSV per rilevare possibili varianti eterozigoti composte
Pubblico
Formazione, Utenti finali avanzati, Utenti finali/Desktop, Tester
Interfaccia utente
Altalena Java
Linguaggio di programmazione
Java
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere recuperata da https://sourceforge.net/projects/project123vcf/. È stato ospitato in OnWorks per poter essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
