Questa è l'app di Windows denominata MANTI la cui ultima versione può essere scaricata come maize_summary.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MANTI con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI
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FAGOTTINO
DESCRIZIONE
MANTI è una soluzione di annotazione e valutazione N-termini one-stop shop. MANTI era precedentemente (s)conosciuto come muda.pl prima della v3.7, il progetto è stato rinominato MANTI.pl con v3.7 il 2019-06-24.
Riunisce le informazioni da 4 (o facoltativamente 5) diversi file di output MaxQuant in un file master adatto esplicitamente per analisi di proteine neo-termini. L'ancora centrale per la raccolta dei dati è il file modificationSpecificPeptides.txt: dati aggiuntivi vengono dedotti da diversi altri file di origine dalla cartella txt MaxQuant. Forse utile anche per normali scopi di proteomica, ma questo script è fortemente ottimizzato per l'identificazione e la convalida di proteine neo-termini. Un'interfaccia grafica è disponibile come Yoğurtlu_MANTI (uno script Perl/Tk) + esegui. versioni dell'applicazione per Win10 senza la necessità di avere Perl installato localmente.
Per una spiegazione molto dettagliata dei parametri dello script e della strategia di valutazione, consultare l'ampio manuale in PDF che accompagna ogni versione.
Caratteristiche
- Valutazione MaxQuant N-termini
- Valutazione e validazione di Protein-Termini
- (UniProt) annotazione e assemblaggio dei dati
- Integrazione Limma, LOCALIZER, TargetP2.0 e TopFINDER
- Rimappatura di Termini individuati per correggere le Isoforme
- Molte opzioni di visualizzazione con gli script R forniti
Pubblico
Scienza / Ricerca
Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Perl
Categorie
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/manti/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.
