זוהי הפקודה ali2gff שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
ali2gff - מודול לתרגום קבצי פלט MUMmer לפלט בפורמט gff.
תַקצִיר
ali2gff [-r] [-t ] [-x ] [-y ] [-H] [-f] [-h]
אפשרויות
-ח, - עזרה
הצג סיכום של אפשרויות.
-r החלף את סדר הרצפים (רצף 1 על ציר y, רצף 2 על ציר x).
-t
שים את התווית 'מסגרת' בפלט gff.
-x
ציין את שם המין עבור species1 (ברירת מחדל: "Seq1").
-y
ציין את שם המין עבור species2 (ברירת מחדל: "Seq2").
-i התעלם מזהויות ברצף מלא.
-f כתוב פלט לקובץ.
השתמש ב-ali2gff באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net