bp_composite_LDp - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

bp_composite_LD -i filename.prettybase.txt --sortbyld > outfile

תַקצִיר

bp_composite_LD -i filename.prettybase [-o out.LD] [-f prettybase/csv] [--sortbyld] [--noconvertindels]

תיאור
זהו סקריפט המאפשר דרך קלה לחשב LD מורכב.

אפשרויות
-i או --in שם הקובץ

פורמט גנוטיפ -f או --format (prettybase או CSV)

--sortbyld כדי לראות נתונים ממוינים לפי LD במקום רק את כל
ערכי LD של זוג site1/site2.

שם קובץ פלט -o או --out, אחרת יודפס ל-STDOUT

--noconvert (מתאים לקובץ בפורמט prettybase בלבד)
אם צוין לא ינסה להמיר indel
מצבים ל-'I' ומחקים מצבים ('-') ל-'D'.

-h או --עזרו לעיין בתיעוד זה

AUTHOR ג'ייסון סטג'יץ', מתיו תרנגול
לפרטים נוספים:

מתיו האן, ג'ייסון סטג'יץ'

השתמש ב-bp_composite_LDp באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net