זוהי הפקודה createChemistryHeader שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו בחינם כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
createChemistryHeader.py - צור כותרת SAM עם כימיה לרצף PacBio
מידע
תיאור
שימוש: getChemistryHeader.py [-h] [--debug] --bas_files BAS_FILES
[BAS_FILES ...]
input_alignment_file output_header_file
createChemistryHeader יוצר כותרת SAM המכילה את מידע הכימיה שבו משתמש
רֶטֶט.
מקומי טיעונים:
input_alignment_file
קובץ SAM או BAM שהופק על ידי BLASR.
output_header_file
שם קובץ הכותרת של SAM או BAM שייווצר עם מידע כימיה
טעון.
אופציונלי טיעונים:
-h, - עזרה
הצג הודעת עזרה זו וצא
--לנפות
פלט מידע יומן מפורט. (ברירת מחדל: False)
--bas_files BAS_FILES [BAS_FILES ...]
קבצי ה-bas או ה-Bax המכילים את הקריאות שהיו מיושרות ב-
input_alignment_file. יכול להיות גם מקור של קבצי bas או bax. (ברירת מחדל: אין)
השתמש ב- createChemistryHeader באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net