fpromlke - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

fpromlk - פילוגנית חלבון לפי סבירות מקסימלית

תַקצִיר

fpromlk -סדר פעולות seqsetall - אינטפילי עץ [-nקטגוריות מספר שלם] -ציון מערך
-קטגוריות נכסים [משקולות נכסים] -אורכים בוליאני [-דֶגֶם רשימה]
[-גמא רשימה] -מקדם גמא לצוף -נגמאקט מספר שלם -מקדם אינברציות לצוף
-נינווארקט מספר שלם -invarfrac לצוף -nhmmקטגוריות מספר שלם -המרייטס מערך
-הממ הסתברויות מערך -adjsite בוליאני -למבדה לצוף -לבלבל מספר שלם
-זֶרַע מספר שלם -גלוֹבָּלִי בוליאני [-מחוץ מספר שלם] -תיק אוסף [-פוֹרֶל לְמַתֵג]
-outtreefile אוסף [-נתוני הדפסה בוליאני] [-התקדמות בוליאני] [-טביעת עץ בוליאני]
[-היפסטייט בוליאני]

fpromlk עזרה

תיאור

fpromlk היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "פילוגניה:רצף מולקולרי".

אפשרויות

קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות seqsetall
קובץ המכיל יישור רצף אחד או יותר

- אינטפילי עץ

-nקטגוריות מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1

-ציון מערך

-קטגוריות נכסים

משקולות נכסים

נוסף סעיף
-אורכים בוליאני
ערך ברירת מחדל: N

-דֶגֶם רשימה
ערך ברירת מחדל: Jones-Taylor-Thornton

-גמא רשימה
ערך ברירת מחדל: n

-מקדם גמא לצוף
ערך ברירת מחדל: 1

-נגמאקט מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1

-מקדם אינברציות לצוף
ערך ברירת מחדל: 1

-נינווארקט מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1

-invarfrac לצוף
ערך ברירת מחדל: 0.0

-nhmmקטגוריות מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1

-המרייטס מערך
ערך ברירת מחדל: 1.0

-הממ הסתברויות מערך
ערך ברירת מחדל: 1.0

-adjsite בוליאני
ערך ברירת מחדל: N

-למבדה לצוף
ערך ברירת מחדל: 1.0

-לבלבל מספר שלם

-זֶרַע מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1

-גלוֹבָּלִי בוליאני
ערך ברירת מחדל: N

-מחוץ מספר שלם

תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף

-פוֹרֶל לְמַתֵג
ערך ברירת מחדל: Y

-outtreefile אוסף

-נתוני הדפסה בוליאני
ערך ברירת מחדל: N

-התקדמות בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y

-טביעת עץ בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y

-היפסטייט בוליאני
ערך ברירת מחדל: N

השתמש ב-fpromlke באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net