זוהי הפקודה garniere שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
garnier - מנבא מבנה משני של חלבון בשיטת GOR
תַקצִיר
גרניאר -סדר פעולות המשך -idc מספר שלם -תיק לדווח
גרניאר עזרה
תיאור
גרניאר היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "חלבון: מבנה תלת מימד".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות המשך
מתקדם סעיף
-idc מספר שלם
במאמרם, GOR מזכירים שאם אתה יודע משהו על המבנה המשני
תכולת החלבון שאתה מנתח, אתה יכול לעשות טוב יותר בחיזוי. 'idc' הוא
אינדקס לקבוצה של מערכים, dharr[] ו-dsarr[], המספקים 'קבועי החלטה'
(dch, dcs), שהם קיזוזים המוחלים על המשקולות עבור הסליל והגיליון
(להאריך) תנאים. אז, idc=0 אומר אל תשתמש בקיזוז הקבוע של ההחלטה, ו-idc=1 עד 6
מציין שיש להשתמש בשילובים שונים של קיזוז dch,dcs.
תְפוּקָה סעיף
-תיק לדווח
השתמש ב-garniere באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
