gt-readjoiner-assembly - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

gt-readjoiner-assembly - בניית גרף מחרוזות וקווי פלט.

תַקצִיר

gt מצטרף מחדש הרכבה [אפשרות...]

תיאור

-סט קריאה [מחרוזת]
ציין את שם ערכת הקריאה (ברירת מחדל: לא מוגדר)

-spmfiles [ערך]
מספר קבצי SPM כדי לקרוא את זה חייב להיות שווה לערך של -j עבור החפיפה
שלב (ברירת מחדל: 1)

-l [ערך]
ציין את אורך SPM המינימלי (ברירת מחדל: 0)

-חיתוך עומק [ערך]
ציין את המספר המינימלי של צמתים בקונטיג (ברירת מחדל: 3)

-חתך אורך [ערך]
ציין את האורך המינימלי של קונטיג (ברירת מחדל: 100)

-שגיאות [כן|לא]
חפש תכונות גרף שעשויות לנבוע משגיאות רצף והסר אותן
(ברירת מחדל: לא)

-בּוּעָה [ערך]
מספר סיבובים של הסרת בועות p לביצוע (ברירת מחדל: 3)

-מבוי סתום [ערך]
מספר סיבובים של הסרת מבוי סתום לביצוע מבוי סתום (ברירת מחדל: 10)

-מבוי סתום-עומק [ערך]
ציין את העומק המרבי של נתיב לקודקוד קצה שלפיו הנתיב יהיה
נחשב למבוי סתום (ברירת מחדל: 10)

-v [כן|לא]
להיות מילולי (ברירת מחדל: לא)

-q [כן|לא]
לדכא הודעות פלט סטנדרטיות (ברירת מחדל: לא)

עזרה
הצג עזרה עבור אפשרויות בסיסיות ויציאה

-עזרה+
הצג עזרה עבור כל האפשרויות וצא

-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת

דיווח באגים

דווח על באגים לgt-users@genometools.org>.

השתמש ב-gt-readjoiner-assembly באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net