gt-seq - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

gt-seq - נתח את קבצי הרצף הנתונים ובנה את קבצי האינדקס המתאימים.

תַקצִיר

gt seq [אפשרות ...] sequence_file [...]

תיאור

-ליצור מחדש [כן|לא]
צור מחדש קבצי אינדקס, גם אם הם קיימים כבר (ברירת מחדל: לא)

-שואופסטה [כן|לא]
הצג את כל הרצפים (בפורמט FASTA) (ברירת מחדל: לא)

-showseqnum [ערך]
הצג רצף עם מספר נתון (בפורמט FASTA) (ברירת מחדל: לא מוגדר)

-gc-תוכן [כן|לא]
הדפס תוכן GC (עבור קבצי DNA) (ברירת מחדל: לא)

-מצב [כן|לא]
הצג סטטיסטיקות רצף (ברירת מחדל: לא)

-seqlengthdistri [כן|לא]
הצג התפלגות אורך רצף (ברירת מחדל: לא)

רוחב [ערך]
הגדר רוחב פלט עבור הדפסת רצף FASTA (0 משבית את העיצוב) (ברירת מחדל: 0)

-o [שם הקובץ]
הפנה פלט לקובץ שצוין (ברירת מחדל: לא מוגדר)

-gzip [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס של gzip (ברירת מחדל: לא)

-bzip2 [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס bzip2 (ברירת מחדל: לא)

כוח [כן|לא]
לכפות כתיבה לקובץ פלט (ברירת מחדל: לא)

עזרה
הצג עזרה וצא

-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת

דיווח באגים

דווח על באגים ל[מוגן בדוא"ל]>.

השתמש ב-gt-seq באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net