gt-sequniq - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

gt-sequniq - סינון רצפים חוזרים בקבצי רצף נתונים.

תַקצִיר

gt sequniq [אפשרות ...] sequence_file [...]

תיאור

-לְהַאִיץ [כן|לא]
גם לסנן רצפים שההשלמה ההפוכה שלהם זהה כבר לרצף
פלט (ברירת מחדל: לא)

-v [כן|לא]
להיות מילולי (ברירת מחדל: לא)

רוחב [ערך]
הגדר רוחב פלט עבור הדפסת רצף FASTA (0 משבית את העיצוב) (ברירת מחדל: 0)

-o [שם הקובץ]
הפנה פלט לקובץ שצוין (ברירת מחדל: לא מוגדר)

-gzip [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס של gzip (ברירת מחדל: לא)

-bzip2 [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס bzip2 (ברירת מחדל: לא)

כוח [כן|לא]
לכפות כתיבה לקובץ פלט (ברירת מחדל: לא)

עזרה
הצג עזרה וצא

-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת

הכלי יסיר רק כפילויות זהות של רצפים, לא תת-מחרוזות הכלולים
בתוך רצפים אחרים.

דיווח באגים

דווח על באגים ל[מוגן בדוא"ל]>.

השתמש ב-gt-sequniq באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net