זוהי הפקודה oddcompe שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
oddcomp - זיהוי חלבונים עם הרכב מילות רצף שצוין
תַקצִיר
oddcomp -סדר פעולות המשך -בקובץ בקובץ -חלון מלא לְמַתֵג חלון מספר שלם
-התעלם בוליאני -תיק אוסף
oddcomp עזרה
תיאור
oddcomp היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "חלבון:קומפוזיציה".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות המשך
-בקובץ בקובץ
זהו קובץ בפורמט של הפלט המופק על ידי 'compseq' המשמש להגדרה
התדרים המינימליים של מילים בניתוח זה.
דרוש סעיף
-חלון מלא לְמַתֵג
הגדר אפשרות זו על (Y) אם אתה רוצה שגודל החלון יוגדר לאורך של
חלבון הנוכחי. אחרת, השאר אפשרות זו לא מוגדרת, ובמקרה זה תתבקש
לשימוש בגודל חלון. ערך ברירת מחדל: N
חלון מספר שלם
זהו גודל החלון שבו יש לספור. לכן אם אתה רוצה לספור תדרים פנימה
למתוח של 40 א' כדאי להזין כאן 40. ערך ברירת מחדל: 30
מתקדם סעיף
-התעלם בוליאני
קוד חומצת האמינו B מייצג Asparagine או Aspartic acid והקוד Z מייצג
גלוטמין או חומצה גלוטמית. אלו אינם קודים בשימוש נפוץ ואולי תרצו שלא
לספור מילים המכילות אותן, רק לציין אותן בספירת המילים 'אחרות'. בְּרִירַת מֶחדָל
ערך: Y
תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף
זה קובץ התוצאות.
השתמש ב-oddcompe באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net
