זוהי אפליקציית לינוקס בשם NGSReadsTreatment שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור NgsReadsTreatmentGI_v1.2.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם NGSReadsTreatment עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
NGSReadsTreatment
Ad
תיאור
NGSReadsTreatment, כלי חישובי להסרת קריאות משוכפלות במערך נתונים של קצה זוגי או יחיד. NGSReadsTreatment יכול להתמודד עם קריאות מכל פלטפורמה עם אורכי רצף זהים או שונים. באמצעות המבנה ההסתברותי Cuckoo Filter, הקריאות המיותרות מזוהות ומוסרות על ידי השוואת הקריאות עם עצמם. לפיכך, לא נדרשת דרישה מוקדמת מעבר למכלול הקריאות. NGSReadsTreatment הושווה לכלים אחרים להסרת יתירות בניתוח קבוצות שונות של קריאות. התוצאות הוכיחו ש-NGSReadsTreatment היה טוב יותר מהכלים האחרים הן בכמות היתירות שהוסרו והן בשימוש בזיכרון חישובי עבור כל הניתוחים שבוצעו.הערה: כדי להפעיל את הגרסה החדשה השתמש בגרסה 11 של Java.
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/ngsreadstreatment/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.