זוהי אפליקציית לינוקס בשם denovo_solid_pipeline אשר את המהדורה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-denovo_solid_pipeline_1.0.1.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם denovo_solid_pipeline עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
denovo_solid_pipeline
Ad
תיאור
denovo_solid_pipeline (DSP) הוא צינור חצי אוטומטי להרכבת גנום קצר באמצעות נתוני רצף SOLiD. המאפיינים העיקריים של הצינור הם אופטימיזציה של מספר ריצות תיקון הקריאה ומשאבי חישוב באמצעות תכנות דינמי. ל-DSP יש גם את היתרון על פני הצינור הזמין כרגע (denovo2) של יצירת קונטיגים נוספים המתאימים לשלבי הרכבה נוספים, מה שמגדיל את הסיכוי לזהות שגיאות רצף ו/או אתרים פולימורפיים.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
קונסולה/טרמינל
שפת תכנות
מעטפת יוניקס
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/denovosolid/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
