זוהי אפליקציית לינוקס בשם FOCUS שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור FOCUS_0.31_python_2.7.XX.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם FOCUS עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
פוקוס
תיאור
FOCUS, הרכב חדשני וזריז המבוסס על שימוש בריבועים קטנים לא שליליים כדי ליצור פרופיל ולדווח על אורגניזמים בשפע הנמצאים בדגימות מי-טגנומיות ושכיחותם היחסית ללא תלות באורך רצף. התוכנית נבחנה עם מטאנומים מדומה ואמיתי, והתוצאות מראות שהגישה שלנו חוזה את האורגניזמים בקהילות אקראיות.זמינות ויישום: ניתן למצוא את הקוד המיושם ב-Python כאן ושרת אינטרנט בכתובת http://edwards.sdsu.edu/FOCUS.
תלות: מדוזה, Numpy ו-Scipy.
ציטוט FOCUS
Silva, GGZ, DA Cuevas, BE Dutilh ו-RA Edwards, 2014: FOCUS: מודל נטול יישור לזיהוי אורגניזמים במטאנומים באמצעות ריבועים קטנים לא שליליים. PeerJ, 2, e425,doi:10.7717/peerj.425.
תכונות
- מטאנומים
- עוֹשֶׁר
- גילויים
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/metagenomefocus/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
