זוהי אפליקציית לינוקס בשם GapFiller שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור GapFiller-1.1.1.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם GapFiller עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
Gapfiller
Ad
תיאור
GapFiller הוא רכיב אסמבלר מקומי כדי למלא את החסר בתוך קריאות זוגיות.
זה יכול לשמש גם ל-DNA וגם ל-RNA והוא נבדק על נתוני Illumina.
ניתן להשתמש ב-GapFiller בכל פעם שיש להרכיב רצף החל מקראות המונחת על קצותיו, בתנאי הערכה רופפת של אורך הרצף.
תכונות
- פורמט קלט נתמך: FASTQ (.gz, .bz2), FASTA (.gz, .bz2), SAM, BAM
- פרמטרי הרכבה הניתנים להתאמה אישית גבוהה
- אפשרות לציין מערכי נתונים שונים לזריעה והרכבה
- אפשרות לאחסן מידע על פריסה (קריאת מיקום וכיוון בתוך קונטיגים שהורכבו)
ממשק משתמש
שורת הפקודה
שפת תכנות
C + +
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/gapfiller/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
