זוהי אפליקציית הלינוקס בשם Grinder שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד בתור Grinder-0.5.4.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Grinder עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
מלתעה
Ad
תיאור
Grinder הוא כלי ביו-אינפורמטי רב-תכליתי בקוד פתוח ליצירת ספריות רצף של רובה ציד ו-amplicon מדומים עבור כל פלטפורמות הרצף הראשיות.
תכונות
- רובה ציד או אמפליקון (למשל 16S rRNA) לקרוא ספריות
- תמיכת omics ליצירת מערכי נתונים גנומיים, תעתיקים, פרוטאומיים, מטאנומיים, מטאטרנסקריפטומיים או מטאפרוטאומיים
- התפלגות אורך קריאה שרירותית ומספר קריאות
- סימולציה של שגיאות PCR ורצף (כימרות, מוטציות נקודתיות, הומופולימרים)
- תמיכה במערך נתונים של קצה מזווג (זוג שותף).
- הגדרות ספציפיות של שפע דרגה או שפע נתון ידני עבור כל גנום, גן או חלבון
- יצירת מערכי נתונים בעלי עושר נתון (גיוון אלפא)
- מערכי נתונים קשורים יכולים לחלוק מספר משתנה של גנומים (גיוון בטא)
- מודלים של ההטיה שנוצרה על ידי אורכי גנום משתנים או מספר העתק גנים
- מנגנון פרופיל לאחסון אפשרויות מועדפות
- זמין לביולוגים או למשתמשי כוח באמצעות ממשקים מרובים: GUI, CLI ו-API
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
קונסולה/טרמינל
שפת תכנות
פרל
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/biogrinder/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
