זוהי אפליקציית לינוקס בשם Just_Preprocess_My_Reads שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם Just_Preprocess_My_Reads עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
פשוט_לעבד את_הקריאות שלי
Ad
תיאור
מזהה rRNA, מזהמים, חיתוך בצורה סטנדרטית וכו'. שומר על זוגות קריאה. נבנה עבור פרויקטים בתפוקה גבוהה של אש ושכח (טרה-בייט של נתונים).
משתמש ב-pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (אופציונלי)
תכונות
- עיבוד מקדים של illumina
- בדיקת זיהום
קהל
מדע/מחקר
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
