זוהי אפליקציית לינוקס בשם MARAGAP שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור Data-Maragap.rar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם MARAGAP עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
MARAGAP
Ad
תיאור
מאמר זה מציג את 'MARAGAP', צינור ייחוס להרכבת גנום. MARAGAP משתמש בעקרון של אורך תיאור מינימלי כדי לקבוע את רצף ההתייחסות האופטימלי עבור המכלול. רצף ההתייחסות האופטימלי משמש כתבנית להסקת היפוכים, הוספות, מחיקות ו-SNPs בגנום היעד. MARAGAP משתמש בגישה אלגוריתמית כדי לזהות ולתקן היפוכים ומחיקות, גישה מבוססת גרף De-Bruijn להסקת ההחדרות, כלי יישור מקומי ל-affine-gap-affine-match להערכת המיקומים של אותן הוספות ומסגרת אומדן בייסיאנית עבור SNPs.זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/refasp/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
