זוהי אפליקציית לינוקס בשם multipsq שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור multiPSQ_1.1.0_windows_x86.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם multipsq עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
multipsq
תיאור
תוכנה לסיווג אורגניזמים המבוססת על תוצאות מאלגוריתמים של ריצוף פירופלקס המבוצעים על מערכת Pyro-Mark ID (Qiagen). ניתן לעצב את המבחנים באמצעות התוכנה mpsqed הזמינה מ https://sourceforge.net/projects/mpsqed/
ניתן ליישם ריצוף פירוז עבור הקלדת פתוגן מבוססת-נוקלאוטיד-פולימורפיזם בודד (SNP) או למתן מידע על רצף של מתיחות DNA קצרות. עם זאת, עבור פתוגנים מסוימים לא ניתן לבצע הקלדה מולקולרית בהסתמך על SNP בודד או מתיחה של רצף קצר, מה שמצריך התייחסות למספר אזורים גנומיים. גישה מהירה מבטיחה היא יישום בו-זמנית של מספר פריימרים לרצף, הנקרא ריבוי פירו-רצף. פריימרים אלו יוצרים פירוגרמת טביעת אצבע אשר מורכבת מסכום כל הפירוגרמות הבודדות שמקורן בכל פריימר בשימוש. MultiPSQ מאפשר ניתוח וסיווג של פירוגרמות מרובות שמקורן ב-Pyrosequencing פריימרים שונים.
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
Qt
שפת תכנות
C + +
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/multipsq/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
