זוהי אפליקציית לינוקס בשם ParamIT לרוץ בלינוקס מקוון שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם ParamITPack-1.0.tar.bz2. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם ParamIT כדי לרוץ בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
בצילומי מסך
Ad
ParamIT יפעל בלינוקס מקוון
תיאור
ParamIT הוא ערכת כלים המסייעת בפיתוח של פרמטריזציה של שדה כוח מכני מולקולרי של מולקולות קטנות דמויות גרר בתוך פרוטוקול CHARMM שדה כוח כללי (CGenFF). ערכת הכלים שפותחה עוזרת לחוקרים בדרכים הבאות: 1) אוטומציה של יצירת קבצי קלט מרובים עבור תוכניות מכניקה קוונטית ומולקולרית, 2) אוטומציה של ניתוח הפלט ו-3) החלפת השימוש בתוכניות MM מלאות בתוכנית מתמחה מהירה יותר. הכלים שפותחו כוללים: 1) מחולל מתחמי מולקולה-מים עם ממשק משתמש גרפי (GUI), 2) ניתוח תדרים חצי אוטומטי באמצעות מטריצת חלוקת אנרגיה פוטנציאלית סמלית והשוואה של קואורדינטות פנימיות אופטימליות, 3) GUI להתאמת מטען עם שלושה מצבים : ידני, דגימה של מונטה-קרלו או כוח גס, ו-4) ממשק משתמש (GUI) להתאמת מונחים דו-הדרליים. השימוש בכלים אלה מקטין את מאמץ העבודה, מוריד שגיאות קלט ידניות ומפחית את הזמן הדרוש למאמצי פרמטר מדויק של MM.קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
שורת הפקודה, Tk
שפת תכנות
ג, פייתון
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/paramit/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.
