פונטוס לרוץ בלינוקס הורדה מקוונת עבור לינוקס

זוהי אפליקציית לינוקס בשם Pontos לרוץ בלינוקס מקוון, שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם Pontos-3.0.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.

בצילומי מסך

פונטוס לרוץ בלינוקס מקוון

תיאור

פונטוס היא תוכנת Java גרפית קלה לשימוש לחישוב של מטריצות מרחק (או דמיון) לא מתוקנים מיישורי רצף DNA בפורמט PHYLIP. זה גם יוצר יישור "הבדל" מאלה הרגילים (ולהיפך).

הוא יכול להתמודד עם פערים ואי בהירות בדרכים שונות.

פערים יכולים להיות:
- הכל בשימוש;
- כולם התעלמו;
- התעלמו רק בקצות הרצפים, באופן זוגי;
- התעלמו רק בקצוות, אך כעת באופן גלובלי (למעשה גזירת כל היישור לרצפים הרחוקים ביותר מהקצוות).

אי בהירות (דברים כמו R, Y, N, W וכו' ברצף DNA) ניתנות לטיפול כמו:

- לשקול עמימות כמו תמיד שונות;
- לשקול עמימות כשונה באופן חלקי (למשל R יהיה 0.5 שונה מ-A או G);
- התעלם מאי בהירות בכל השוואה זוגית;
- הסר את כל העמודות, באופן גלובלי, המציגות אי בהירות.

פונטוס נכתב בלינוקס, אבל צריך לרוץ בכל מערכת שבה Java עובדת. Pontos מורשה תחת גרסה 3 של GPL.

קהל

מדע/מחקר, משתמשי קצה/שולחן עבודה

ממשק משתמש

Java Swing

שפת תכנות

Java

זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/pontos/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.